По мнению Минфина, банки не должны взимать комиссию за перечисление страховых взносов во внебюджетные фонды. В Законе о взносах на этот счет есть прямая норма.

По данным «настучавшего» в Минфин налогоплательщика, его банк с октября стал взимать комиссию за перечисление взносов, причем со ссылкой на письмо самого Минфина. Но это письмо к взносам отношения не имеет.

Так что, если банки взимают с вас подобную комиссию, то можете требовать ее возврата или зачета в счет платы за прочие услуги банка. 

Источник: Письмо Минфина России от 03.11.2011 N 03-02-07/1-380

Это и другие свежие разъяснения ведомств ищите в ГК N 22.