При наличии ОП организация должна платить НДФЛ с доходов сотрудников этих подразделений по месту их нахождения <п. 7 ст. 226 НК РФ>. С 2016 года организации, имеющие ОП, представляют формы 2-НДФЛ и 6 НДФЛ в отношении доходов сотрудников этих подразделений по месту учета таких ОП <п. 2 ст. 230 НК РФ>. До 2016 года действовал такой же порядок представления справок 2-НДФЛ <см., например, Письма Минфина от 06.02.2013 N 03-04-06/8-35; ФНС от 30.05.2012 N ЕД-4-3/8816@>.
Таким образом, справки 2-НДФЛ за 2015 год в отношении сотрудников ОП вам нужно представить в налоговую по месту нахождения ОП.
В результате у вас фактически возникнет излишне уплаченный НДФЛ по месту нахождения головной организации и недоимка по НДФЛ по месту нахождения ОП.
Поскольку вы удержали НДФЛ и перечислили его своевременно и в полном объеме, оснований для привлечения организации к налоговой ответственности по ст. 123 НК РФ <Минфина от 10.10.2014 N 03-04-06/51010>. Такой вывод согласуется с позицией ВАС <Постановление Президиума ВАС РФ от 24.03.2009 N 14519/08>. Нет также оснований для начисления пени <Письмо ФНС России от 07.04.2015 N БС-4-11/5717@>.
В общем-то, налоговая, обнаружив у агента недоимку и переплату по НДФЛ, возникшие в результате нарушения порядка перечисления налога, должна будет самостоятельно произвести зачет (пп. 1, 5, 14 ст. 78 НК РФ; Постановление ФАС Северо-Западного округа от 30.07.2012 по делу N А56-48850/2011). Однако как будут обстоять дела на практике, сказать сложно. Поэтому, лучше не надеяться на налоговую, а действовать самим. Как именно - зависит от того, где находится ОП:
<если> ОП и головная организация находятся в одном субъекте РФ - подайте заявление об уточнении платежа, исправив КПП и ОКТМО (п. 7 ст. 45 НК РФ);
<если> ОП и головная организация находятся в разных субъектах РФ - подайте заявление о проведении зачета (пп. 4, 14 ст. 78 НК РФ).
Нужное
