Есть давнее Письмо ФНС  <от 18.04.2007 N 04-1-02/306@>, в котором налоговики:
<и> не относят затраты на проживание и проезд к представительским, несмотря на то, что по НК к представительским относятся расходы на транспортное обеспечение доставки участвующих в переговорах лиц к месту проведения мероприятия <п. 2 ст. 264 НК>. Но налоговики и Минфин считают, что сюда относятся только расходы на доставку участников по городу непосредственно к месту проведения мероприятия – от вокзала или гостиницы, например. А оплата проживания, как указывают ведомства, не предусмотрена устанавливающим порядок признания представительских расходов п. 2 ст. 264 НК и не может быть учтена при налогообложении прибыли <Письма Минфина от 01.12.2011 N 03-03-06/1/796 от 16.04.2007 N 03-03-06/1/235>;
<и> по этой причине считают стоимость проезда и проживания доходами участников мероприятия – представителей других юрлиц, полученными в натуральной форме и облагаемыми НДФЛ <п. 1 ст. 210, подп. 1 п. 2 ст. 211 НК>.
Поэтому безопаснее до 1 марта следующего года сдать в ИФНС сообщение о невозможности удержать НДФЛ, т.е. справку 2-НДФЛ с признаком «2» и выдать такую же справку самому физлицу <п. 5 ст. 226 НК>.
Вместе с тем, на наш взгляд, на самом деле дохода у сотрудника компании–клиента в таком случае не возникает. Ведь в рамках этой поездки он выступает не как физлицо в частном порядке, а как представитель компании и выполняет при этом свои служебные обязанности. Следовательно, оплата проезда и проживания не приносит ему как физлицу никакой экономической выгоды, производится не в его интересах и поэтому не является его доходом в целях НДФЛ <ст. 41, подп. 1 п. 2 ст. 211, абз. 11 п. 3 ст. 217 НК>. Если следовать этому подходу, то нужен документ, подтверждающий, что физлицо было в поездке именно в качестве работника компании-клиента в рамках выполнения своего служебного задания. Например, письмо об этом от имени этой компании и/или копия приказа ее руководителя о направлении их сотрудника в командировку. При таком подходе вы не должны сообщать в ИФНС о невозможности удержать НДФЛ. Но это, скорее всего, придется отстаивать в суде.
А расходы на проживание и проезд в налоговом учете можно учесть не как представительские, а как «другие» прочие <подп. 49 п. 1 ст. 264 НК, Постановление ФАС МО от 23.05.2011 N КА-А40/4584-11>. Но и это тоже путь в суд.