Действительно, согласно, в частности, ст.2 ГК РФ, предпринимательская деятельность – это самостоятельная, осуществляемая на свой риск деятельность, направленная на систематическое получение прибыли от пользования имуществом, продажи товаров, выполнения работ или оказания услуг. При этом извлечение прибыли является целью предпринимательской деятельности, а не ее обязательным результатом (п.13 Постановления Пленума ВС от 24.10.2006 № 18).

Официальная позиция Минфина подтверждает, что организации вправе при ведении предпринимательской деятельности учитывать расходы, даже если в конкретных отчетных (налоговых) периодах доходы от такой деятельности отсутствуют (письма Минфина от 28.12.2017 № 03-03-06/1/87897, от 25.08.2010 № 03-03-06/1/565, от 21.05.2010 № 03-03-06/1/341, письмо ФНС от 21.04.2011 № КЕ-4-3/6494).

Таким образом, в ответе на требование ИФНС организация, чья деятельность в целом направлена на получение дохода, должна указать, что понесенные ею расходы соответствуют положениям ст.252 НК РФ, признаны в том периоде, в котором они возникли исходя из условий сделок (п.1 ст.272 НК РФ), и подлежат учету при определении налоговой базы по налогу на прибыль в порядке, установленном НК РФ, независимо от наличия доходов от реализации в соответствующем налоговом периоде. В подтверждение такой точки зрения можно сослаться на указанные выше письма Минфина и ФНС.