Если в договоре стоимость товаров (работ, услуг) без учета налога не выделена и не предполагается менять цену договора, тогда повышение ставки НДС с 18% до 20% скажется отрицательно на финансовом положении продавца. Поскольку он должен отгрузить товары (выполнить работы, оказать услуги) по ранее согласованной цене (п. 17 Постановления Пленума ВАС от 30.05.2014 № 33).

И если в 2018 году эта цена включала в себя НДС по ставке 18%, то в 2019 году она включает в себя НДС по ставке 20%.

Если в декабре вы будете выставлять счет на оплату товаров (работ, услуг), которые будут отгружены уже в январе, то в нем вам надо указывать ставку НДС 20%. 

Получается, что без внесения изменений в договор у продавца снижается стоимость товаров (работ, услуг). При этом покупатель не должен вам доплачивать 2%, поскольку цена с учетом налога в договоре согласована.

Это подтверждает и специалист ФНС cм. ответ на вопрос «Отказ покупателя от оплаты 2% НДС».

У вас снизится выручка для целей налогообложения прибыли с учетом 20%-ного налога, предъявленного в счете-фактуре покупателю (п. 1 ст. 248 НК РФ).

Чтобы не было проблем с налоговыми органами при проверке,  рекомендуем все-таки заключить с покупателем дополнительное соглашение к договору с указанием прежней стоимости товаров (работ, услуг) и новой ставки НДС (20%).