Премии учитываются при расчете отпускных, если они предусмотрены системой оплаты труда и связаны с результатами труда (выполнением трудовой функции) <подп. "н" п. 2 Положения об особенностях порядка исчисления средней заработной платы, утвержденного Постановлением Правительства РФ от 24.12.2007 N 922; Письмо Минтруда от 03.08.2016 N 14-1/ООГ-7105>.
Наверняка выплаченная вами премия за производственные показатели предусмотрена Положением о премировании и включается в систему оплаты труда. Значит, всю ее сумму надо учесть при расчете среднего заработка <ст. 135 ТК РФ; Письмо Минздравсоцразвития от 13.10.2011 N 22-2/377012-772>.
На всякий случай отметим, что НЕ относятся к системе оплаты труда и не учитываются в расчете среднего заработка разовые премии, например к юбилейным датам, праздникам, за выполнение срочной работы вне должностных обязанностей и так далее <Письмо Роструда от 23.10.2007 N 4319-6-1>.