Как мы понимаем, взаимозачетом с поставщиком вы погашаете взаимные требования по оплате уже отгруженных товаров. В таком случае факт проведения взаимозачета не влияет на ваше право принять к вычету входной НДС. Для этого необходимо соблюдение условий, установленных п. 2 ст. 171, п. 1 ст. 172 НК РФ. Был ли приобретенный товар оплачен и в какой форме, для применения вычетов в общем случае значения не имеет.
Сам по себе факт неуплаты НДС поставщиком, отразившим данную операцию в декларации по НДС, не может быть основанием для отказа покупателю в вычете, если последний проявил должную осмотрительность при выборе контрагента и заключенная сделка была реально исполнена <п. 31 Обзор судебной практики ВС N 1 (2017), утв. Президиумом ВС 16.02.2017; Письме ФНС России от 23.03.2017 N ЕД-5-9/547@; п. 3 ст. 54.1 НК РФ>.