Сотрудник должен был сразу оформить себе больничный по карантину с кодом «03». Такой больничный у него открывался бы с первого дня самоизоляции, а закрывался бы днем, предшествующим дню, когда ему выписали больничный по болезни с кодом «01» < п. 58 Порядка, утв. Приказом Минздравсоцразвития от 29.06.2011 N 624н >. Если «карантинный» больничный есть, то он полностью оплачивается из средств ФСС < ч. 6 ст. 6 закона от 29.12.2006 N 255-ФЗ >. Вам период карантина сотрудника нужно отметить в табеле учета рабочего времени кодом «Т» или «20», поскольку ни дня такой нетрудоспособности не оплачивается из средств работодателя.

Если у сотрудника нет больничного по карантину, то действуйте по ситуации.

Ситуация 1. Сотрудник работал удаленно период карантина до болезни. Проставляете в табеле «Я» или «01» и оплачиваете работу в обычном размере.

Ситуация 2. Сотрудник не работал во время карантина, но этот период пришелся на нерабочие дни с сохранением зарплаты. Оплачиваете дни карантина как обычные отработанные дни, в табеле ставите утвержденный у вас код для таких дней.

Ситуация 3. Сотрудник не работал, период карантина не попал на нерабочие дни с сохранением зарплаты. Платить за отсутствие на работе вы не должны. В табеле поставьте, например, «НН» или «30».