Ваш вопрос неясен. Для каких целей вы хотите рассчитать НДС на основе оборотной ведомости? Если для целей самопроверки бухгалтерского учета и отдельного НДС-учета, то можно ориентироваться на данные счета 68, субсчет «Расчеты по НДС». По этому счету отражается и начисление НДС, и вычеты. НДС с авансов может отражаться на отдельном субсчете счета 76.

Обороты по реализации (отраженные на счетах 90-1 и 91-1 можно взять за основу для проверки правильности начисления НДС (берем обороты по реализации по ставке 20% и умножаем на 20%). Однако не забывайте, что этот налог может начисляться в том числе и с еще не реализованных товаров (если они отгружены покупателям), и с полученных авансов. Так что весьма вероятны нестыковки.

Если вы хотите определить верную сумму начисленного в определенном периоде НДС и сумму налога, принятую к вычету, то надо учитывать не все операции скопом (конечно, если речь не идет о начислении НДС с розничных продаж по единой ставке за день), а каждую реализацию и каждую покупку отдельно. Для этого надо вести книгу покупок и книгу продаж, в которой надо своевременно регистрировать счета-фактуры: как выставляемые вашей организацией, так и полученные от поставщиков.

Данные этих книг должны соответствовать бухгалтерским записям на счетах 19, 68 (субсчет «Расчеты по НДС») и в некоторых случаях – на счете 76 «Расчеты по НДС с авансов».