Если организация расторгнет трудовой договор с работником и в пределах двухлетнего срока заключит с ним ГПД как с самозанятым гражданином, то она признается налоговым агентом по НДФЛ (пп. 6 п. 1 ст. 208, п. 4 ст. 226 НК РФ). Также организация является плательщиком страховых взносов с сумм соответствующих вознаграждений и будет обязана уплачивать их в общеустановленном порядке для выплат по ГПД (п. 1 ст. 420, пп. 2 п. 3 ст. 422 НК РФ).

Признать ГПХ трудовым может потребовать в предписании государственный инспектор труда об устранении нарушения части второй статьи 15 ТК РФ, сам работник, обратившись в суд, ФНС РФ при признании (в судебном порядке) трудовых отношений с доначислением налогов. Правомерность заключения договора гражданско-правового характера устанавливается судом.