Если работник обратился к работодателю с заявлением о предоставлении ему имущественного НДФЛ-вычета не с начала года, то предоставление такого вычета начинается именно с месяца, в котором подано соответствующее заявление.

Источник: Определение Верховного Суда РФ от 26.12.2014 N 304-КГ14-6337 Определение Верховного Суда РФ от 26.12.2014 N 304-КГ14-6337

Кстати, Минфин придерживается аналогичного мнения Письмо Минфина от 21 августа 2013 г. N 03-04-05/34221, поясняя что в такой ситуации вычет нужно предоставить со всей суммы дохода, начисленной работнику нарастающим итогом с начала года. Но за месяцы, предшествующие подаче заявления, возврат НДФЛ делать не надо.

Напомним также, что заявление на вычет вы обязаны принять от работника в любой день, даже если это будет сопряжено определенными неудобствами для вас (например, когда заявление работник приносит в зарплатный день) Заявление сотрудника на имущественный вычет работодатель обязан принять в любой день.

Подсказки по предоставлению имущественного вычета работнику вы найдете в наших Типовых Ситуаций КАК ПРЕДОСТАВИТЬ РАБОТНИКУ ИМУЩЕСТВЕННЫЙ ВЫЧЕТ ПО НДФЛ НА ПРИОБРЕТЕНИЕ (СТРОИТЕЛЬСТВО) ЖИЛЬЯ?