Даже если это заявление работник подал в день выплаты зарплаты, а пересчитывать ее заново вам совсем не хочется.

Об этом сказал Минфин (Письмо Минфина от 27.06.14 № 03-04-05/31208), также пояснив, что вычет работодателем предоставляется, начиная с месяца, в котором получено соответствующее заявление от сотрудника. Если же на этот момент НДФЛ уже удержан без учета вычета, то возникшую переплату можно вернуть из бюджета.

И учтите, что в случае вашего отказа принять заявление на вычет, работник имеет полное право обратиться в суд.

Разобраться с тем, как вернуть излишне перечисленный НДФЛ, поможет наша статья в ГК, 2014, № 13