Если вы сменили режим налогообложения, но до перехода с УСН на ОСН контрагент так и не погасил свою задолженность перед вами, то НДС с суммы этого долга вам начислять не нужно.

Источник: Письмо Минфина России от 02.03.2015 N 03-07-11/10711 Письмо Минфина России от 02.03.2015 N 03-07-11/10711

Ведь реализация товаров (работ, услуг) произошла  еще тогда, когда вы были упрощенцем. А, соответственно, не были плательщиком НДС. И тот факт, что вы потом начали применять общий режим налогообложения, никоим образом не меняет момента реализации.

А вот учесть сумму задолженности в «прибыльных» доходах придется. Когда это сделать, вам подскажут наши Типовые Ситуации ЧТО НАДО СДЕЛАТЬ ПРИ ПЕРЕХОДЕ С УСН НА ОСН (УТРАТЕ ПРАВА НА УСН)?