Если налоговики доначислили вам налоги, то эти суммы можно включить в состав прочих «прибыльных» расходов на дату вступления в силу решения по результатам проверки.

Источник: Письмо Минфина от 06.04.2015 г. N 03-03-06/1/19158 Письмо Минфина от 06.04.2015 г. N 03-03-06/1/19158

Если же потом какие-либо суммы вы «отбили» в суде, то их необходимо учесть в внереализационных доходах на дату вступления в силу судебного решения.

Конечно, речь идет о тех налогах, которые в принципе разрешено учитывать в расходах (налог на имущество, транспортный и земельный налоги и т.д.). Кстати, также уменьшить базу по налогу на прибыль можно на начисленные Фондами взносы.

  < ... >

И раз мы заговорили о проверках, то хочется напомнить, что на привлечение вас к налоговой ответственности за неуплату (неполную уплату) налогов по ст.122 НК РФ у налоговиков есть три года. Причем, этот срок начинает течь со следующего дня после окончания налогового периода, в котором произошла неуплата налога (Определение ВС РФ от 10.02.2015г. № 2-КГ14-3).

К примеру, если в ходе ревизии начислен НДС за 1 квартал 2012г., то, чтобы штраф был законен, решение по результатам проверки должно быть вынесено не позже 30 июня 2015г. Т.е. раз налог за 1 квартал 2012г. был недоплачен, то нарушение вами было совершено во 2 квартале 2012г. (20 апреля 2012 – крайний срок уплаты НДС за 1 квартал), соответственно, срок исковой давности для привлечения к ответственности начинает течь с 1 июля 2012г.