Если организация, арендующая у физлица помещение, произвела в нем неотделимые улучшения, стоимость работ по такому улучшению – облагаемый НДФЛ доход «физика»-арендодателя.

Источник: Письмо Минфина от 29.12.2016 № 03-04-05/79439

Ведь, как известно, в базу по НДФЛ включаются все доходы, полученные физлицом, как в денежной, так и в натуральной формах. А к «натуральным» доходам, среди прочего, относятся выполненные в интересах «физика» работы.

В рассматриваемом случае датой получения «натурального» дохода считается день окончания действия договора аренды. Причем исчислить и удержать НДФЛ с этого дохода (или сообщить в ИФНС о невозможности удержания) должна организация-арендатор в качестве налогового агента.

Кстати, перечисляемые физлицу арендные платежи при аренде недвижимости или земельных участков также делают из арендатора налогового агента по НДФЛ.