Если реализуемый компанией жилой дом еще не доведен «до кондиции», освобождение от НДС не применяется.

Источник: Письмо Минфина от 02.11.17 № 03-07-11/72106

Согласно НК, не подлежат обложению НДС операции по реализации жилых домов, жилых помещений, а также долей в них. При этом жилым может считаться только помещение, пригодное для постоянного проживания граждан. Т.е. отвечающее установленным санитарным и техническим правилам и нормам.

Соответственно, объект незавершенного строительства не может быть признан полноценным жилым домом. А значит, реализация такой недвижимости облагается налогом на добавленную стоимость в общеустановленном порядке.