Для того, чтобы считаться резидентом РФ в целях уплаты НДФЛ, гражданин должен находиться на территории страны не менее 183 календарных дней в течение 12 месяцев подряд. Причем, краткосрочная отлучка за границу для обучения включается в дни «резидентского» пребывания.

Источник: Письмо ФНС от 15.10.2015 № ОА-3-17/3850

Правда, лишь в том случае, когда продолжительность поездки менее 6 месяцев.

Подтвердить, что «физик» находился за рубежом именно с целью освоения образовательных программ, могут копии страниц загранпаспорта с учебными визами, выданными иностранными консульствами, и отметками пограничного контроля о пересечении границы, а также копии договоров с иностранными образовательными учреждениями об оказании соответствующих услуг.

Кстати, если гражданин покинул страну в лечебных целях, действуют аналогичные правила Письмо Минфина от 02.07.2015 № 03-04-05/38173.