Связано это с тем, что данный вид расходов не содержится в закрытом перечне тех трат, на которые можно уменьшить базу при расчете упрощенного налога.

Такова позиция Минфина (Письмо Минфина от 16.06.2014 № 03-11-06/2/28551)

В принципе, данный запрет предсказуем, так как раньше Министерство было против включения в состав «упрощенных» расходов затрат, связанных с проведением аттестации рабочих мест Письмо Минфина от 18.02.2013 N 03-11-06/2/4248.

Но, откровенно говоря, позиция финансового ведомства вызывает недоумение. Ведь спецоценку (а ранее аттестацию) упрощенцы проводят не по собственной прихоти, а в силу установленной законодательством обязанности ст.212 ТК РФ.

Конечно, если вы готовы спорить с налоговиками, то можете рискнуть и списать затраты на спецоценку, как услуги сторонних организаций пп.5 п.1, п. 2 ст.346.16 НК РФ пп.6 п.1 ст.254 НК РФ. То есть по аналогии с медосмотрами, которых также нет в «упрощенном» перечне, но несмотря на это Минфин все же разрешил учитывать их при расчете налога Письмо Минфина от 22.07.2005 № 03-11-04/2/31. Правда, свою позицию наверняка придется отстаивать в суде, и не факт, что он вас поддержит. Ведь проведение спецоценки это не что иное, как расходы на обеспечение нормальных условий труда и мер по технике безопасности. И эти расходы в целях исчисления налога на прибыль поименованы как прочие - в пп.7 п.1 ст. 264 НК РФ пп.7 п.1 ст. 264 НК РФ. Но в гл.26.2 НК РФ гл.26.2 НК РФ, к сожалению, отсылки к этой статье нет.