А именно тем, кто применяет спецрежимы или освобождение от НДС по ст. 145 НК. Для этого нужно подписать с каждым таким покупателем соглашение о несоставлении счетов-фактур. Можно просто добавить такое условие в договор.

Но прежде чем отказываться от составления счетов-фактур для таких покупателей, оцените все плюсы и минусы. Налоговую базу удобно считать по книге продаж, а реализация, на которую нет счета-фактуры, туда не попадет. Придется либо составлять счет-фактуру в одном экземпляре для себя, либо брать для расчета налоговой базы данные бухучета. Подробнее об этом – в ГК 2014 № 16 стр. 20.

Кстати, в связи с нововведениями Минфин дал разъяснения специально для упрощенцев, задумавшихся о том, каким документом подтверждать расход в виде уплаченного при приобретении товаров (работ, услуг)  НДС Письмо Минфина от 08.09.2014 №03-11-06/2/44863. Так вот, такой расход можно подтвердить, к примеру, платежкой, которой упрощенец перечислил деньги за товар.