При условии, что такие компенсации не являются частью вознаграждения физического лица – подрядчика. Например, вы оплачиваете ему проезд или проживание, но не в его  личных интересах, а в ваших – в целях выполнения работ/услуг.

Тут у подрядчика никакой экономической выгоды не возникает Письмо Минфина России от 29.04.2013 N 03-04-07/15155. К таким же выводам 2 года назад пришла ФНС Письмо ФНС России от 25.03.2011 N КЕ-3-3/926, но Минфин столь простой логике до сих пор противился.

А теперь Минфин наконец «разложил по полочкам» и механизм необложения таких компенсаций:
- если вы сами оплачиваете такие расходы (покупаете билеты, заказываете гостиницу, трансфер), то просто не включаете их в облагаемый доход подрядчика;
- если вы компенсируете его расходы, то предоставляете ему при выплате дохода профессиональный вычет по представленным документам.