Нарушение порядка привлечения работника к такой работе не должно сказываться на его праве получать повышенную оплату. Например, при превышении максимально допустимого времени такой работы. А стало быть, повышенную оплату можно включить в налоговые расходы Письмо Минфина России от 23.05.2013 N 03-03-06/1/18410.

А вот в командировках никакой «сверхурочной» оплаты быть не может – по крайней мере, именно такой вывод можно сделать из свежего письма Минфина. Ведь работнику за этот период выплачивается средний заработок и возмещаются расходы, связанные с командировкой, но не зарплата! Кроме того, работодатель в большинстве случаев физически не может проверить, чем и сколь долго работник был занят в командировке. Так что если не хотите проблем, просто учтите это в премиях или повышенных суточных.