Даже если суд, утверждая мировое соглашение, по которому организация обязуется выплатить физлицу денежную компенсацию, не разделил причитающуюся «физику» сумму и сумму подлежащего удержанию НДФЛ, у организации все равно возникают обязанности налогового агента по НДФЛ.

Источник: Письмо Минфина от 11.01.2018 № 03-04-06/462

Правда, в такой ситуации удерживать и перечислять НДФЛ с суммы компенсации компания не вправе. Зато ей придется сообщить в ИФНС по месту своего учета о невозможности удержать налог. Сделать это нужно, представив не позднее 1 марта года, следующего за годом выплаты, справку по форме 2-НДФЛ, в строке "признак" которой указывается код "2".

Сумму налога «физик», получивший компенсацию, заплатит в бюджет самостоятельно, на основании присланного налоговиками уведомления.