При оказании комплекса услуг можно выставить один общий счет-фактуру

Организации или ИП, оказывающие одному покупателю несколько услуг в комплексе, могут не выставлять по отдельному счету-фактуре по каждой из этих услуг.

Источник: Письмо Минфина от 10.11.2015 № 03-07-09/64493 Письмо Минфина от 10.11.2015 № 03-07-09/64493

В таком случае достаточно составить единый НДС-документ, в котором в отдельных позициях будут перечислены виды оказанных услуг. Нарушением это являться не будет.

Не забывайте, что счет-фактура должен быть выставлен не позднее пяти календарных дней, считая со дня отгрузки товара (выполнения работ, оказания услуг), со дня передачи имущественных прав или со дня получения сумм оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг), передачи имущественных прав п.3 ст.168 НК РФ.