Большинство вычетов по НДФЛ предоставляются физлицу налоговым агентом на основании письменного заявления. При этом, если в НК форма подачи такого заявления прямо не указана, то заявление может быть подано в виде электронного документа, подписанного квалифицированной электронной подписью.

Источник: Письмо Минфина от 03.05.2017 № 03-04-06/27013

Так, чтобы получить стандартный, социальный, имущественный или профессиональный вычет у налогового агента, гражданин должен принести заявление, написанное на бумаге. Это четко прописано в Налоговом кодексе.

А вот в отношении инвестиционного вычета форма подачи заявления не установлена.

Поэтому Минфин считает правомерным предоставление физлицом электронного заявления, если оно направляется в целях получения инвестиционного вычета либо учета налоговым агентом фактически произведенных без участия налогового агента расходов, связанных с приобретением и хранением ценных бумаг.