Минфин по уже устоявшейся традиции выпустил разъяснение, смысл которого сводится к пассажу «нет реализации – нет вычетов по НДС».

Подобные разъяснения ведомство выпускает примерно раз в полгода. Аргументация прежняя:
- вычеты уменьшают исчисленную сумму налога ;
- раз суммы налога из-за отсутствия реализации в конкретном периоде не имеется, то и уменьшать на вычеты нечего.

Ну а мы по традиции напомним вам, что в случае спора суд (а может даже и вышестоящая УФНС) наверняка вас поддержит. Некоторые суды считают связь между исчисленным налогом и правом на вычеты надуманной. А некоторые считают, что налоговики занимаются схоластикой – при отсутствии операций по реализации налог все же исчисляется, просто он равен нулю. Можно, впрочем, и вовсе не давать налоговикам повода отказать в вычете и возмещении НДС и хотя бы одну облагаемую операцию за квартал совершить.

Источник: Письмо Минфина России от 14.12.2011 N 03-07-14/124