В противном случае выявленная по итогам камеральной или выездной проверки недоимка задвоится.

Источник: Письмо ФНС от 25.08.2017 № АС-4-15/16906@

Дело в том, что в карточке расчета с бюджетом (КРСБ) отражается разница к доплате или уменьшению между уточненной декларацией и предыдущей сданной. А доначисления налогов по результатам проверки сотрудники инспекции вносят в карточку отдельно на основании послепроверочного решения.

Соответственно, сданная плательщиком уточненка с отраженными в ней «проверочными» доначислениями в сочетании с занесенными налоговиками в КРСБ теми же суммами приведет к некорректному сальдо расчетов с бюджетом. Причем не в пользу плательщика.

Кстати, если инспекторы обнаружат, что плательщик в уточненке зачем-то отразил доначисления ИФНС, то у него могут быть затребованы соответствующие пояснения.