Если компания задешево продала гражданину недвижимость, то матвыгоду для целей НДФЛ можно не считать

По крайнем мере, Минфин не усмотрел у покупателя материальной выгоды в ситуации, когда договорная цена существенно ниже кадастровой Письмо Минфина России от 28.06.2012 N 03-04-05/3-790. Правда, это касается ситуации, когда компания не продавала идентичную недвижимость другим (невзаимозависимым) лицам. Тут сравнивать цену сделки действительно не с чем.

Однако учтите, налоговики вполне могут посчитать, что если покупатель - ваш работник, то в результате покупки недвижимости по заниженной цене он получил от вас так называемый натуральный доход (разница между рыночной и договорной ценой). И тогда безопаснее рассчитать и удержать НДФЛ с этого дохода.