Техника добровольной уплаты НДФЛ за счет налогового агента
Вопрос 1. Как рассчитать налог?
Для примера возьмем выплату самозанятому, которую ошибочно расценили как подпадающую под НПД. Но все, что покажем на этом примере дальше, актуально и для иных случаев неправомерного неудержания НДФЛ, в том числе и из разных доходов работников.
В начале июля 2024 г. организация выплатила вознаграждение в сумме 100 тыс. руб. по договору подряда самозанятому. В марте 2025 г. поняли, что под НПД эта сумма не подпадала — к примеру, на тот момент еще не прошли 2 года со дня увольнения из организации. Следовательно, при выплате физлицу-подрядчику денег в июле 2024 г. организация была обязана удержать и перечислить НДФЛ по ставке 13%. Но не сделала этого.
Требуется исправить ошибку: исчислить и заплатить НДФЛ с пенями и сдать уточненные расчеты 6-НДФЛ за 9 месяцев и за 2024 г. Новых выплат этому человеку не планируется, удержать не из чего, и поэтому организация платит налог за свой счет.

Сумму НДФЛ, которая была неправомерно не удержана налоговым агентом, агенту иногда приходится платить из своего кармана
Встречается два способа расчета суммы налога к уплате, и только один из них правильный и соответствует нормам НК. Рассмотрим оба, чтобы вы не допустили ошибку.
Способ 1. Правильный. Исчислить налог в обычном порядке — как часть выплаченной физлицу суммып. 1 ст. 225 НК РФ. В нашем примере НДФЛ равен 13 тыс. руб. (100 тыс. руб. х 13%). Это соответствует действительности: доход в сумме 100 тыс. руб. был выплачен физлицу полностью, без удержания из него налога.
Способ 2. Неправильный. Исчислить НДФЛ так, как будто он был из выплачиваемого физлицу дохода удержан, но не перечислен в бюджет (то есть как будто перечисленные человеку деньги — это сумма уже за вычетом НДФЛ). В нашем примере налог был бы равен 14 943 руб. (100 тыс. руб. х 13% / (100% – 13%)).
Вот почему это неправильно:
•в соответствии с НК НДФЛ исчисляется не сверх выплачиваемой физлицу суммы дохода, а как ее частьп. 1 ст. 225 НК РФ;
•при таком способе расчета получилось бы, что доход физлица равен 114 942,53 руб. (100 тыс. руб. х 100% / (100% – 13%)). Следовательно, эту сумму пришлось бы показать в составе доходов в уточненных 6-НДФЛ, в том числе и в справке о доходах за период выплаты денег. А налог, соответственно, отразить не только как исчисленный, но и как удержанный у физлица.